Karyotyping là quá trình sắp xếp và ghép nối tất cả các nhiễm sắc thể được tìm thấy trong một sinh vật để có được cái nhìn bao quát về toàn bộ nhiễm sắc thể 'bản đồ' của một cá thể.
Nhưng trước tiên hãy chắc chắn rằng chúng ta hiểu nhiễm sắc thể là gì ở nơi đầu tiên. Nhiễm sắc thể là các cấu trúc trông tương tự như các sợi được chứa trong nhân của mỗi tế bào của cơ thể bạn.
Mỗi cấu trúc nhiễm sắc thể chứa toàn bộ kế hoạch thông tin di truyền của cơ thể bạn. Điều này quyết định cách cơ thể của bạn được cấu trúc, phản ứng với các kích thích, khuynh hướng đối với bệnh tật, vv. Phụ nữ có nhiễm sắc thể 2 'X' và nam giới có một nhiễm sắc thể 'X' và một 'Y'. Mỗi tế bào trong cơ thể bạn chứa 23 cặp nhiễm sắc thể, tổng cộng 46 nhiễm sắc thể.
Để các nhà nghiên cứu có thể hiểu được trình tự nhiễm sắc thể của từng bệnh nhân, họ sử dụng phần mềm karyotyping . Loại phần mềm này được thiết kế để thực hiện phân tích nhiễm sắc thể và nó đánh giá cấu trúc và số lượng nhiễm sắc thể của một người. Bằng cách này, các nhà nghiên cứu và nhà khoa học có thể phát hiện ra sự bất thường.
Trong bài viết này, chúng tôi sẽ khám phá một số tùy chọn phần mềm tuyệt vời cho phép bạn thực hiện phân tích karyotyping.
- 1
ArgusSoft
ArgusSoft là một tùy chọn phần mềm tuyệt vời cho phép bạn tự động tạo ra các nhiễm sắc thể của con người theo vị trí của dải và cũng có thể được sử dụng để tạo kiểu cho động vật và nhiễm sắc thể của thực vật trực tuyến.
Các tính năng chính:
- G, Q, R nhuộm
- Karyotyping tự động của nhiễm sắc thể người với sự công nhận uốn cong
- Karyotyping tự động của nhiễm sắc thể lợn
- 3 cơ sở tích hợp các chữ tượng hình chuẩn của nhiễm sắc thể người với các mức độ rõ ràng khác nhau - 400, 550 và 850 cấp độ
- Có thể thêm cơ sở của chữ tượng hình cromosome tiêu chuẩn cho các loài động vật và thực vật khác
- Phương pháp chuẩn bị mẫu
- Nhập hình ảnh tấm metaphase bằng máy ảnh và máy quét
- Kèm theo một hình ảnh với đồ họa
- Tự động phân chia nhiễm sắc thể ứng dụng và tiếp xúc
- So sánh các nhiễm sắc thể và chữ tượng hình
Bạn cũng có thể sử dụng ArgusSoft để huấn luyện hệ thống nhận dạng nhiễm sắc thể bằng các chế phẩm được cài đặt sẵn, có thể chuyển hình ảnh tấm metaphase và karyogram trong cơ sở dữ liệu tích hợp, có thể tạo ra các mẫu báo cáo, karyogram chính xác và lưu trữ và in hình ảnh và kết quả phân tích.
Bạn có thể được đào tạo và hỗ trợ sử dụng ArgusSoft từ trang web chính thức của họ. Trung tâm hỗ trợ bao gồm dịch vụ đào tạo, bảo trì và tư vấn.
Hãy dùng thử ArgusSoft
- 2
HiBand bằng hình ảnh quang phổ ứng dụng
HiBand là một phần mềm được tạo bởi Ứng dụng hình ảnh quang phổ ứng dụng, có thể thực hiện phân tích nhiễm sắc thể tiên tiến bằng cách sử dụng các tính năng karyotyping kỹ thuật số. Phần mềm này
sử dụng các tính năng quét tự động để phân tích sâu về cấu trúc nhiễm sắc thể.
Bạn có thể sử dụng một loạt các tính năng được tìm thấy trong HiBand để lập chỉ mục, đếm, lưu trữ và quản lý dữ liệu kết quả. Bạn cũng có thể sử dụng phần mềm mạnh mẽ này để quét chuỗi nhiễm sắc thể tự động.
Các kết quả thu được bằng cách sử dụng các tính năng karyotyping được tìm thấy HiBand có thể được lưu trữ ở một vị trí an toàn với các lớp được mã hóa và bảo vệ bằng mật khẩu. Điều này cho phép bạn yên tâm về việc mất bất kỳ dữ liệu tuần tự quan trọng nào và vì điều này, cũng cải thiện hiệu quả trong phòng thí nghiệm của bạn.
Sắp xếp qua các kết quả được thực hiện một cách rất dễ dàng, bạn chỉ cần tìm kiếm chuỗi nhiễm sắc thể cụ thể và tất cả các kết quả được hiển thị trong một màn hình có chứa quyền truy cập dễ dàng để sửa đổi, đánh giá và thêm thẻ vào bất kỳ của các tập tin.
Các tính năng chính:
- Brightfield Karyotyping-G-Band và R-Band
- Huỳnh quang Karyotyping-Q-Band, R-Band và FISH
- Quang phổ Karyotyping
- Đếm nhiễm sắc thể tự động
- Lập chỉ mục và phân loại nhiễm sắc thể
- Nâng cao phân tách nhiễm sắc thể và nâng cao hình ảnh tiên tiến
- Thư viện hình ảnh - có thể trình bày tất cả các ẩn dụ trường hợp và karyotypes trên một màn hình
- Có thể so sánh nhiễm sắc thể - nhìn thấy chúng cạnh nhau
- Ý tưởng bất thường - bạn có thể thêm nhiễm sắc thể, tế bào, chữ tượng hình và chú thích trong trình tạo hình ảnh
HiBand sử dụng quy trình làm việc hoàn toàn tự động để tăng hiệu quả phòng thí nghiệm, có các tính năng quét 'bắt đầu và đi bộ', tìm ẩn dụ, tự động đọc mã vạch, tải lên hình ảnh trong thời gian thực trong quá trình quét slide và cũng xuất sang Cổng thông tin LIS của phòng thí nghiệm và Cơ sở dữ liệu.
Hãy thử HiBand
- 3
Ikaros của MetaSystems
Hệ thống karyotyping này có giao diện người dùng rất trực quan cung cấp tất cả các tính năng trên một màn hình. Điều này cho phép dễ dàng và nhanh chóng truy cập vào tất cả các thông tin thu được.
Ikaros có thể được sử dụng với neon, đây là một nền tảng được thiết kế để trợ giúp với dữ liệu hình ảnh và tổ chức tình huống. Neon thu thập dữ liệu từ tất cả các công việc hình ảnh, nguồn bên ngoài và cho phép bạn trình bày chúng theo cách dễ hiểu bằng cách sử dụng bảng điều khiển quản lý trường hợp.
Công cụ này cho phép bạn luôn có sẵn thông tin quan trọng và được lưu trữ một cách an toàn, nhưng sử dụng thuật toán quản lý dữ liệu rất mạnh, có nhiều cách hay để quan sát dữ liệu và có thể cung cấp các tìm kiếm cụ thể dựa trên từ khóa và đặc điểm dữ liệu.
Kiểm tra thêm thông tin về neon và các tính năng của nó ở đây .
Ikaros hỗ trợ nhiều kỹ thuật tạo dải khác nhau - G-Band và R-Band của Brightfield, Q-Band huỳnh quang, R-Band và FISH -, cung cấp một số lượng lớn các hình thức karyogram định nghĩa trước cho người, thực vật và động vật. Bạn có thể dễ dàng chỉnh sửa các biểu mẫu này để thêm bất kỳ dữ liệu nào cần thiết cho loại nghiên cứu bạn đang thực hiện.
Thực tế là bạn có thể so sánh các nhiễm sắc thể theo lớp hoặc bằng karyogram, cung cấp cho bạn thông tin rất hữu ích cho phép bạn dễ dàng xác định sự khác biệt.
Hãy dùng thử
- 4
MetaClass của Microptic
MetaClass là một phần mềm karyotyoping tuyệt vời được thiết kế theo kiểu mô-đun. Phần mềm này giúp bạn thực hiện các nghiên cứu karyotyping và FISH về nhiễm sắc thể.
MetaClass được hình thành từ các mô-đun sau:
- Cơ sở dữ liệu MetaClass
Cơ sở dữ liệu có thể được cài đặt với bất kỳ mô-đun nào của MetaClass. Cho phép bạn lưu trữ chi tiết bệnh nhân và cho phép bạn dễ dàng truy cập vào kết quả. Bạn có thể tạo báo cáo tùy chỉnh bằng bất kỳ ngôn ngữ nào với mô-đun này.
- Karyotyping MetaClass
Cho phép bạn nghiên cứu một kiểu nhân sau khi các hình ảnh của giai đoạn chuẩn bị metaphase đã được ghi lại và sắp xếp chúng thành các cặp dựa trên kích thước, vị trí, v.v. Mô-đun này mang lại cho bạn kết quả chất lượng tuyệt vời khi nói đến các dải nhiễm sắc thể và nó cũng có thể cung cấp cho bạn các báo cáo tìm kiếm chuyên nghiệp.
Các tính năng chính bao gồm:
- Nghiên cứu về karyotype được phân tích dưới độ phóng đại 100X của trường sáng
- Có thể chụp một số hình ảnh Metaphase
- Chất lượng hình ảnh có thể thay đổi để có kết quả rõ nét hơn
- Tự động phân loại nhiễm sắc thể
- 4 lượt xem màn hình - Cửa sổ nhiễm sắc thể Metaphase, Karyotype và không được phân loại
- Có thể hiển thị nguyên mẫu nhiễm sắc thể
- Nhiễm sắc thể không được phân loại có thể được sửa chữa tự động hoặc thủ công - xếp chồng, tách, giao cắt, xoay, v.v.
- Các tệp phiên MTC hoặc hình ảnh BMP có thể được lưu và tải lại bất cứ lúc nào
- Có thể xuất các nhiễm sắc thể riêng lẻ vào Cơ sở dữ liệu Metaclass với khả năng thêm nhận xét và ghi chú
Dưới đây là một ví dụ về báo cáo karyotyping Metaclass.
- CÁ CÁ
Đây là một mô-đun phân tích cho phép bạn có được hình ảnh huỳnh quang IN SITU (FISH). Mô-đun này chụp ảnh bằng cách sử dụng các đầu dò DNA huỳnh quang và cho phép bạn xác nhận các bất thường di truyền - trisomies, mocrodelection, sắp xếp lại nhiễm sắc thể, v.v.
Hình ảnh FISH được phân tích dưới độ phóng đại 100 lần và, để có độ rõ hình ảnh rộng hơn, cũng có thể chụp ảnh với các bộ lọc khác nhau.
Nếu bạn muốn tìm hiểu thêm thông tin về các mô-đun được trình bày ở trên và các tính năng khác, bạn có thể xem qua danh mục MetaClass.
Nếu bạn là người tò mò và muốn xem báo cáo thu được bằng phương pháp FISH, bạn có thể
một tệp PDF mẫu.Hãy dùng thử MetaClass
- 5
GenASis Bandview
GenASis Bandview là một phần mềm karyotyping tuyệt vời khác được xây dựng từ các mô-đun với các capabitilites khác nhau. Bạn có thể sử dụng ứng dụng này để thực hiện chẩn đoán karyotyping và có được kết quả kiểm tra chính xác.
Phần mềm này cho phép bạn tùy chỉnh đầy đủ quy trình làm việc và quy trình chẩn đoán, tùy thuộc vào nhu cầu của công ty bạn và các mục tiêu bạn đang cố gắng đạt được.
Một loạt các công cụ được cung cấp trong BandView có thể dễ dàng truy cập chỉ bằng một cú nhấp chuột và cung cấp trải nghiệm karyotyping G / R / C / Q-Band mạnh mẽ. Bạn có thể chọn giữa quy trình làm việc tự động hoặc thủ công khi định vị siêu hình và chụp ảnh.
Bất thường nhiễm sắc thể, nếu được tìm thấy, có thể được quan sát thông qua việc thêm, xóa hoặc sắp xếp lại vật liệu di truyền của bệnh nhân. Với BandView, bạn có thể sử dụng dải kỹ thuật phân tử FISH.
FISH sử dụng các đầu dò huỳnh quang để gắn vào các phần khác nhau của nhiễm sắc thể, cho phép phần mềm phát hiện và khoanh vùng các bất thường được tìm thấy trong các chuỗi DNA cụ thể.
Hãy thử GenASis Bandview
Phần kết luận
Trong bài viết này, chúng tôi đã khám phá một số phần mềm karyotyping tự động tốt nhất tồn tại trên thị trường vào cuối năm 2018.
Các tùy chọn phần mềm karyotyping được đề cập trong bài viết này cung cấp cho bạn nhiều tính năng sẽ giúp bạn đạt được mục tiêu của công ty.
Bằng cách sử dụng loại phần mềm này, bạn có thể đếm nhanh hàng ngàn cấu trúc nhiễm sắc thể, phân tích bằng các kỹ thuật chuyên nghiệp khác nhau và tạo báo cáo cấp cao cho phép bạn xác định bất kỳ sự bất thường nào một cách dễ dàng.
Chúng tôi rất thích tìm hiểu ý kiến của bạn về phần mềm chúng tôi đã trình bày trong danh sách top 5 này. Xin vui lòng cho chúng tôi biết bằng cách sử dụng phần bình luận bên dưới.
HƯỚNG DẪN LIÊN QUAN BẠN CẦN KIỂM TRA:
- Cần phần mềm khảo sát cho nghiên cứu học thuật? Dưới đây là 5 công cụ
- 5 phần mềm tốt nhất để viết học thuật
- 10 phần mềm đạo văn tốt nhất để phát hiện nội dung sao chép vào năm 2019
